斗罗大陆3龙王传说故事结束一万年后，冰化了，斗罗联邦科考队在极北之地科考时发现了一个有着金银双色花纹的蛋，用仪器探察之后，发现里面居然有生命体征，赶忙将其带回研究所进行孵化。蛋孵化出来了，可孵出来的却是一个婴儿，和人类一模一样的婴儿，一个蛋生的孩子。
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昔日长留仙山沦为冷清景区，员工静恒接到关停通知，收拾行李时碰倒木箱，唤醒了因被遗忘而沉睡的四瑞兽——主事业的苍龙、主财运的白虎、主姻缘的朱雀、护健康的玄武。因神力衰减，四瑞兽的许愿回应十分“抽象”，反倒让长留仙在网上走红。随着人气渐旺，白泽、麒麟等瑞兽相继苏醒，静恒与这群瑞兽联手，让古老传说在现代焕
32年前的审判之日，空间被撕开裂缝，异界怪物入侵，不到1个月，世界人口少了30亿，在末日到来之际，人类中出现了“异能者”，正因有了这些异能者，人类也开始了对怪兽的反击，为了阻止从传送门中入侵的怪物，人类为了培养猎人，1：1000的求生游戏——《失落之城》上线，游戏中拥有不败战绩的玩家“未知者”，阴差阳错成为了现实世界的猎人，展开了他的拯救世界之路。
