这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历的故事。在结束了在成都地区的旅行后 小智只带上了他最先获得的神奇宝贝——皮卡丘 来到了芳缘地方。但是在到芳缘地方的途中，皮卡丘被火箭队的攻击变得异常奇怪...在AG中，小智和新加入的女主角——小遥，永远支持着小智的小刚，以及小遥的弟弟小胜，一起在芳缘地方，以及到对战开拓区旅行
突然出现的“鬼兽”以压倒性的力量开始攻击人类，城市被摧毁，绝望笼罩着人们，在所有人都快要放弃的时候，有一个影子迎战鬼兽！“你们这些家伙，惹到我了！！”人类面前出现了一丝希望，那竟然是一只鸡！
雷格西渴望未来能和哈鲁在一起，生活在肉食动物和草食动物和平共存的世界。为了这个目标，他继续走在艰难的道路上，反抗邪恶势力，并对抗自己的本能。
爸爸是英雄，妈妈是精灵王，艾莲拥有专属于科学家的独特技能——根据自己的喜好来改变物质的结构与合成。在爸爸、妈妈与精灵们的宠爱下，艾莲幸福成长，却在和爸爸造访人间之际被国王盯上，全家人陷入危机？人类和精灵200百年前的纠葛重新被提起，两族似乎永远无法重归于好……诅咒再一次降临人界，无数无辜人民受害。精灵艾莲决定，运用知识和力量，守护人类也守护家人。
「我」曾一时攀上超热门在线游戏「艾克斯之门ＯＮＬＩＮＥ」的巅峰。在完成某次重大故事后的隔天，想登入游戏时，突然收到「赋予你全新使命」的提示讯息。当我按下「ＹＥＳ」的瞬间，世界被反转了──醒来后，映入「我」眼帘的是──！？
小茜与乱马忙着应付挥舞锅铲的未婚妻、变成家禽的对手，以及好色的武术大师，天道道场的混乱场面持续上演。
